期刊简介
本刊主要报道医学分子生物学领域的最新研究成果，研究进展有及研究方向，适合于广大从事医学分子生物学研究的科技工作者及临床医务人员，生物工程、生化、分子药理、分子病理、免疫学、遗传学等相关人员。
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首页>医学分子生物学杂志
- 杂志名称：医学分子生物学杂志
- 主管单位：中华人民共和国教育部
- 主办单位：华中科技大学同济医学院
- 国际刊号：1672-8009
- 国内刊号：42-1720/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：首届、第二届中国高校特色科技期刊奖期刊收录：剑桥科学文摘, 国家图书馆馆藏, 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美)
K562细胞DHRS4 L1基因新选择性剪接亚型的克隆及二级结构预测
李一凡；罗玮；徐广健；杜冀晖；王磊；周蓓；李蓉；麦丽文；龚慧
关键词：DHRS4L1, 非编码RNA, 选择性剪接, 二级结构
摘要：目的： K562细胞DHRS4L1[ dehydrogenase／reductase （ SDR family） member 4 like 1]的表达及其二级结构分析。方法以K562细胞cDNA为模板， PCR扩增DHRS4[ dehydrogenase／reductase （ SDR fami-ly） member 4]基因簇Ea2转录本。将PCR产物A-T克隆至pGEMT-Easy质粒，对质粒进行DNA Sanger测序。将测序所得序列用NCBI ORF finder分析是否存在编码区，用Clustal Omega分析RNA序列系统树，用RNAfold web server分析RNA小自由能二级结构。结果用RT-PCR和Sanger测序方法发现， K562表达DHRS4L1 Ea2转录本，未检测到其表达DHRS4L2[dehydrogenase／reductase （SDR family） member 4 like 2] Ea1转录本。 K562表达的DHRS4L1 Ea2至少有8种选择性剪接亚型（ KU058702、 KU058703、 KU058704、KU058705、 KU058706、 KU058707、 KU058708、 KU058709），其中6种为首次发现。 KU058702、 KU058703、KU058704、 KU058705和KU058707第二外显子受到多种形式的选择性剪接，恰好仅影响第2臂的二级结构，不影响其他臂的二级结构，提示这些不同亚型的二级结构有一定相似性，第二外显子所对应的二级结构臂可能在区分不同 DHRS4L1亚型功能中发挥关键作用。结论研究发现 K562细胞至少表达8种DHRS4L1选择性剪接亚型，为长链非编码RNA。其二级结构分析为后续研究DHRS4L1在白血病细胞中的潜在功能奠定基础。
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